东区图书馆2013年初投入使用，面积17000平方米，共有六层，是科大图书馆主馆。
1层：图书采购、分类编目典藏空间，另外设有图书馆数据机房。
2层：英才书苑教学学习中心，收藏教材教参类图书和讲义，同时也承担学习沙龙、语言学习交流等工作。另外还有学校的外语教学中心。
3-4层：分别设有社科图书借阅室、科技和外文图书借阅室。同时还设有自助文印服务区、休闲学习区、“中国科大与两弹一星”纪念展览区。
5层：设有马克思主义理论图书阅览室、特藏书库，以及学生自习室
6层：包括数学学院图书馆、科技查新中心（信息咨询部）、会议室、培训室。
